尽管许多报道表征了从人和小鼠血清中分离的exRNA,并且提出血清RNA是疾病生物标志物的主要来源如图1所示,FBS衍生的RNA对基于细胞培养的研究的混杂效应很少受到关注。在这里,我们表征FBS和囊泡耗尽的FBS(vdFBS)的RNA含量,并证明其干扰从条件培养基和可能的细胞RNA分离的细胞衍生的exRNA。
一些观察结果表明FBS相关RNA可能会干扰exRNA的分析。首先,我们检测到的高水平的miR-122,在肝脏中大量表达,但在未检测到的其他组织中的特定miRNA的2,3,在为单层或神经球(培养的神经胶质瘤细胞系的条件培养基图1a)。考虑到胶质母细胞瘤4和培养的胶质瘤细胞中缺乏miR-122表达,
我们认为这一发现可以通过异常有效的miR-122分泌或更合理的培养基作为主要来源来解释。这个miRNA。实际上,miR-122在用于神经胶质瘤细胞培养的新的无条件培养基中非常丰富(图1b),表明条件培养基中的大多数miR-122来自培养基成分而不是细胞分泌。另一种具体的微小RNA,的miR-451A,在不同的细胞和组织在血液中表达具有最高丰度2,在由各种细胞类型分泌的电动汽车被报告为最丰富的miRNA 5,6,7,8,9,10,11。
与这些发现一致,我们发现miR-451a富含从U251和20/3神经胶质瘤单层培养物的条件培养基中分离的沉淀的EV,这些培养基在DMEM / 10%vdFBS中生长。然而,当相同的细胞系在相同的葡萄糖浓度但在无血清的神经球促进条件下培养时,在超速离心(UC)颗粒/ exRNA部分中未检测到miR-451a
为了更好地理解不同培养基的贡献,我们从新鲜的无条件“单层培养基”(2D培养基,含有DMEM / 10%FBS),囊泡耗尽的2D培养基(vd2D,24小时UC后含有FBS)中分离出总exRNA,和“神经球介质”(3D培养基,无血清),并使用qRT-PCR测量miR-451a水平。MiR-451a在2D培养基中含量丰富,在vd2D培养基中略有减少,在3D培养基中几乎检测不到(图1b))。
gibco培养基海智值得注意的是,vd2D培养基中miR-122和miR-451相对于粗2D培养基的水平降低到不同程度,但并未完全消除。虽然不能排除培养条件影响RNA分泌的可能性,但这些发现表明基于UC的囊泡消耗不能完全消除FBS /培养基中的RNA,并且FBS相关的RNA可能导致错误的结果和解释,如先前报道的exRNA中miR-451a富集。